Биоинформатика

Анализ данных геномного секвенирования

  • исследуются различные математические модели сборки генома
  • оценивается вычислительная сложность возникающих в этой области задач
  • разрабатываются применимые на практике алгоритмы сборки генома

При изучении генома живого существа выделяют три основных этапа:

  • секвенирование молекул ДНК, содержащих информацию о генома 
  • сборка геномной последовательности
  • анализ и сравнение геномов

На рисунке показана схема выполнения первых двух из указанных этапов

Изучение генома человека и других живых существ имеет важное прикладное значение. На основании результатов сборки генома конкретного человека возможна реализация индивидуальной медицины – определения предрасположенности к различным болезням, создание индивидуальных лекарств и т. д. Кроме этого на основе результатов исследования геномов растений и животных с использованием методов биоинженерии могут быть выведены новые их виды, обладающие определенными свойствами.

 

Анализ данных экспрессии генов

  • разрабатываются алгоритмы анализа данных, получаемых с помощью специальных чипов
  • анализ данных является одним из этапов разработки экономичных тест-систем для выявления различных заболеваний

 

Интеграция различных источников биологической информации

  • разрабатываются методы и алгоритмы, которые позволяют учитывать несколько видов биологической информации при анализе одного и того же процесса, происходящего в клетке организма.
  • например, совместно с Washington University St. Louis реализуется проект по разработке алгоритмов совместного анализа данных об экспрессии генов и об обмене веществ 

Information © 2015-2019 ITMO University
2015 Department of Information Technology